| 登録選手 2025／ ファーム球団登録選手 |
| ※ | 異動： ○印→新入団、▼印→支配下選手登録からの異動、▲印→育成登録からの異動、△印→ファーム球団間の異動 |
| 選手の年齢は2025年4月1日時点の満年齢 | |
| 登録年数：二軍→ファーム球団在籍年数、育成→育成登録年数、選手→支配下登録年数 |
| 異動 | 位置 | No | 氏 名 | 投打 | 年齢 | 登録年数 | 異動情報 | ||||
| 二軍 | 育成 | 選手 | |||||||||
| オイシックス新潟 （48名） |
投手 | 17 | 三上 朋也 | 右右 | 35 | 2 | 1 | 10 | 2025.08 引退 | ||
| 投手 | 23 | 薮田 和樹 | 右右 | 32 | 2 | 9 | 2025.09 退団 | ||||
| 投手 | 19 | 小林 慶祐 | 右右 | 32 | 2 | 7 | 2025.10 引退 | ||||
| □※ | 投手 | 99 | エスコバー | 左左 | 32 | 1 | 7 | 復帰（元・横浜） | 2025.05 退団 | ||
| 投手 | 47 | 笠原 祥太郎 | 左左 | 30 | 2 | 7 | |||||
| 投手 | 11 | 上村 知輝 | 右右 | 25 | 2 | ||||||
| 投手 | 21 | 牧野 憲伸 | 左左 | 25 | 2 | 2025.10 ドラフト指名（中日・育成） | |||||
| 投手 | *26 | 内田 健太 | 左左 | 24 | 2 | 2025.10 引退 | |||||
| 投手 | 15 | 西村 陸 | 右右 | 24 | 2 | ||||||
| 投手 | 41 | 鈴木 颯人 | 右右 | 24 | 2 | ||||||
| ○ | 投手 | 20 | 日渡 柊太 | 右両 | 24 | 1 | 2025.07 退団 | ||||
| ○ | 投手 | 42 | パディシャーク | 右右 | 24 | 1 | 2025.06 退団 | ||||
| ▲ | 投手 | 31 | 小林 珠維 | 右右 | 23 | 1 | 2 | 3 | ソフトバンクから移籍 | ||
| 投手 | 34 | 伊禮 海斗 | 左左 | 23 | 2 | ||||||
| 投手 | 30 | 能登 嵩都 | 右右 | 23 | 2 | 2025.10 ドラフト指名（阪神） | |||||
| 投手 | *43 | 安城 健汰 | 右右 | 23 | 2 | ||||||
| 投手 | *13 | 目黒 宏也 | 左左 | 23 | 2 | ||||||
| ▼ | 投手 | 14 | 高田 琢登 | 左左 | 22 | 1 | 4 | 横浜から移籍 | |||
| ○ | 投手 | 28 | 今井 亮太 | 右右 | 22 | 1 | |||||
| ○ | 投手 | 29 | 南波 秀 | 右右 | 22 | 1 | |||||
| ○ | 投手 | 48 | 山下 一馬 | 右右 | 22 | 1 | |||||
| ▲ | 投手 | 54 | 滝本 将生 | 右右 | 21 | 1 | 3 | ソフトバンクから移籍 | 2025.10 退団 | ||
| ○ | 投手 | 45 | 高野 結羽 | 右左 | 18 | 1 | |||||
| ○ | 投手 | 46 | 高橋 駿臥 | 右右 | 18 | 1 | |||||
| 捕手 | 27 | 片山 悠 | 右右 | 25 | 2 | 2025.10 退団 | |||||
| ○ | 捕手 | 35 | 中澤 英明 | 右右 | 22 | 1 | |||||
| ○ | 捕手 | 12 | 山田 和 | 右左 | 22 | 1 | |||||
| 捕手 | *56 | 片野 優羽 | 右右 | 20 | 2 | 2025.10 退団 | |||||
| 内野 | 3 | 田中 俊太 | 右左 | 31 | 2 | 6 | |||||
| 内野 | 6 | 永澤 蓮士 | 右右 | 27 | 2 | 2025.10 退団 | |||||
| 内野 | 25 | 小西 慶治 | 右右 | 26 | 2 | ||||||
| 内野 | *7 | 園部 佳太 | 右右 | 25 | 2 | 2 | |||||
| 内野 | 8 | 藤原 大智 | 右両 | 25 | 2 | 2025.10 退団 | |||||
| 内野 | *33 | 伴在 汰文 | 右左 | 23 | 2 | ||||||
| ○ | 内野 | 36 | 佐藤 圭 | 右右 | 22 | 1 | 2025.10 引退 | ||||
| 内野 | 0 | 高 義博 | 右右 | 20 | 2 | ||||||
| 内野 | *62 | 山田 龍青 | 右右 | 19 | 2 | 2025.10 退団 | |||||
| ○ | 内野 | 52 | 岸川 和広 | 右左 | 18 | 1 | |||||
| 外野 | 1 | 陽 ダイ鋼 | 右右 | 38 | 2 | 16 | |||||
| 外野 | 9 | 高山 俊 | 右左 | 31 | 2 | 8 | |||||
| 外野 | 37 | 中山 翔太 | 右右 | 28 | 2 | 4 | |||||
| ○ | 外野 | 32 | 坂口 大輔 | 右左 | 25 | 1 | 2025.10 退団 | ||||
| ○ | 外野 | 5 | 大川 陽大 | 右右 | 25 | 1 | |||||
| 外野 | 51 | 篠田 大聖 | 右左 | 24 | 2 | 2025.10 退団 | |||||
| 外野 | *00 | 知念 大成 | 左左 | 24 | 2 | 2025.10 ドラフト指名（巨人・育成） | |||||
| ○ | 外野 | 55 | 浅井 玲於 | 右左 | 24 | 1 | |||||
| 外野 | 44 | 比嘉 天佑 | 右左 | 23 | 2 | ||||||
| ○ | 外野 | 24 | 上原 裕樹 | 右左 | 22 | 1 | |||||
| ○ | 外野 | 4 | 漆原 幻汰 | 右左 | 22 | 1 | |||||
| ※○ | 外野 | 49 | ロドリゲス | 右右 | 22 | 1 | 2025.06 入団 | 2025.06 退団 | |||
| くふうハヤテ ベンチャーズ静岡 （40名） |
※□ | 投手 | 26 | 藤岡 好明 | 右左 | 40 | 2 | 15 | 2025.03.31 復帰 | 2025.11 退団 | |
| 投手 | 46 | 田中 健二朗 | 左左 | 35 | 2 | 2 | 15 | 2025.09 引退 | |||
| 投手 | 89 | 平間 凛太郎 | 右右 | 30 | 2 | ||||||
| ▲ | 投手 | 40 | 佐藤 宏樹 | 左左 | 26 | 1 | 4 | ソフトバンクから移籍 | |||
| ○ | 投手 | 18 | 足立 真彦 | 右右 | 26 | 1 | 2025.11 退団 | ||||
| 投手 | 53 | 池谷 蒼大 | 左左 | 25 | 2 | 3 | |||||
| 投手 | 15 | 竹内 奎人 | 右右 | 25 | 2 | 2025.09 引退 | |||||
| 投手 | 28 | 野村 裕樹 | 右右 | 25 | 2 | ||||||
| ○ | 投手 | 17 | 宮路 悠良 | 右左 | 25 | 1 | 2025.12 韓国・サムスンに移籍 | ||||
| 投手 | 13 | 奥田 健誠 | 右右 | 24 | 2 | 2025.11 退団 | |||||
| 投手 | 16 | 奥田 域太 | 左左 | 23 | 2 | ||||||
| 投手 | 47 | 東海林 碧波 | 左左 | 23 | 2 | 2025.11 退団 | |||||
| 投手 | 77 | 野口 渉 | 右右 | 23 | 2 | 2025.11 退団 | |||||
| ○ | 投手 | 41 | 高取 将之介 | 右右 | 23 | 1 | |||||
| ○ | 投手 | 44 | 落合 秀市 | 右左 | 23 | 1 | |||||
| ▲ | 投手 | 21 | 笠島 尚樹 | 右右 | 22 | 1 | 4 | 巨人から移籍 | |||
| ○ | 投手 | 20 | 倉橋 瞳人 | 右左 | 22 | 1 | 2025.10 退団 | ||||
| ○ | 投手 | 22 | 濵本 建 | 右右 | 22 | 1 | |||||
| ○ | 投手 | 30 | 大石 航 | 左左 | 22 | 1 | |||||
| ○ | 投手 | 42 | 野里 慶士郎 | 右右 | 22 | 1 | |||||
| 投手 | 11 | 大生 虎史 | 右右 | 19 | 2 | ||||||
| 投手 | 12 | 山田 門 | 右右 | 19 | 2 | ||||||
| 捕手 | 0 | 深谷 力 | 右左 | 24 | 2 | 2025.11 退団 | |||||
| ※○ | 捕手 | 35 | 野口 泰司 | 右右 | 24 | 1 | 2025.04 入団 | 2025.11 退団 | |||
| 捕手 | 10 | 深草 駿哉 | 右右 | 23 | 2 | 2025.11 退団 | |||||
| ○ | 捕手 | 2 | 稲田 太陽 | 右右 | 19 | 1 | 2025.11 退団 | ||||
| 内野 | 5 | 倉本 寿彦 | 右左 | 34 | 2 | 8 | |||||
| 内野 | 24 | 高橋 駿 | 右右 | 27 | 2 | 2025.09 引退 | |||||
| 内野 | 23 | 仲村 来唯也 | 右左 | 25 | 2 | ||||||
| ○ | 内野 | 9 | 和辻 大輝 | 右左 | 25 | 1 | |||||
| ○ | 内野 | 6 | 松田 憲之朗 | 右右 | 24 | 1 | 2025.10 退団 | ||||
| 内野 | 4 | 西川 僚祐 | 右右 | 22 | 2 | 3 | 2025.10 退団 | ||||
| ○ | 内野 | 7 | 張 賢眞 | 右左 | 20 | 1 | 2025.06 退団 | ||||
| ○ | 内野 | 25 | 松本 陣 | 右左 | 18 | 1 | |||||
| ▼ | 外野 | 51 | 鈴木 将平 | 左左 | 26 | 1 | 8 | 西武から移籍 | |||
| 外野 | 1 | 増田 将馬 | 右右 | 26 | 2 | 2025.11 退団 | |||||
| 外野 | 8 | 篠原 玲央 | 右右 | 23 | 2 | ||||||
| ○ | 外野 | 55 | 塩﨑 栄多 | 右左 | 23 | 1 | |||||
| ○ | 外野 | 3 | 平尾 柊翔 | 右左 | 22 | 1 | |||||
| ○ | 外野 | 64 | 江口 聡一郎 | 右右 | 21 | 1 | 2025.09 退団 | ||||
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